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毕业后,她入职上海宏仁医院,成为妇产科医生。1959年12月,肖碧莲获得莫斯科第一医学院副博士学位。曾任国家计划生育委员会科学技术研究所名誉所长、研究员。
她长期从事妇产科、生殖内分泌等研究工作,20世纪60年代在我国开展研制口服避孕药的低剂量和合理配伍研究做出重要贡献。其后从事各种激素避孕药具的临床作用机理研究,为临床应用和探索新的避孕途径提供科学依据。她曾将我国口服避孕药的剂量达到国际最低值,亿万育龄妇女因此受益。1994年当选为中国工程院院士。肖碧莲一生致力于维护女性生殖健康:“为广大女性提供完备的避孕手段,是利国利民的大事。”
第一排右三为肖碧莲
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