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其中，由科技部2015年9月7日开具的罚单显示，经调查发现，华大基因和复旦大学附属华山医院未经许可，与英国牛津大学开展中国人类遗传资源国际合作研究，华大基因将部分人类遗传资源信息从网上传递出境。科技部勒令其停止该项研究、销毁尚未出境的遗传资源材料及研究数据，停止涉及我国人类遗传资源的国际合作，整改验收合格后方可再行开展。
而就在此前不久，华大基因发布了一项中国人基因组学大数据研究成果，该项研究取样自14余万中国人无创产前基因检测数据。
这引起了公众对华大基因基因检测用户隐私外泄的担忧。次日便有媒体发文称华大基因14万孕妇基因组流到海外。
华大基因随后发表澄清声明，针对该媒体发表的消息一一驳斥。同时华大基因向自媒体发出了律师函，要求删文并澄清。当晚，华大基因收到了来自创业板公司管理部的问询函。
10月28日，华大基因在对深交所问询函的回复函中表示，2015年收到该行政处罚后，立即停止该研究工作的执行，并销毁了该研究工作中所有未出境的遗传资源材料以及相关研究数据，且第一时间快速推进了整改工作，经对整改报告进行核查并现场验收后，科技部已批准华大科技恢复开展涉及中国人类遗传资源国际合作工作。
此外，华大基因表示，“14万中国人基因大数据”项目无外方合作机构。而关于“14万中国人基因大数据”研究的知情权，华大研究团队在进行无创产前基因检测前，受检者会签署知情同意书，明确其是否同意样本和数据供科学研究。14万中国人基因大数据来自同意将样本和数据供科学研究的受检者。研究披露的是群体分析结果，不包含任何可识别个人身份信息，不存在泄露个人隐私的风险。
回复还表示，研究全部在境内完成，样本及数据保留在深圳国家基因库，不存在遗传资源数据出境的情况。深圳国家基因库生物样本库建设已获得科技部批准，实行全流程监督，并通过了ISO/IEC27001：2013信息安全管理体系现场评审，以及国家信息安全等级保护3级的认证。
据了解，这是科技部首次对外公开关于人类遗传资源外流出境的处罚信息。中科院人类基因组研究所专家表示，对华大科技等机构的违法查处当时进行了一段时间，时隔多年之后被公开，应该有国家监管机构的用心所在，那就是对行业严加监管。
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